Beiträge zu Datenanalysen, Data Science und neuen Erkenntnisse durch Forschung bei ZB MED.
In ihrem Gastbeitrag fasst Hilda Bastian die Informationsveranstaltung zum Projekt OLSPub, das das Ziel verfolgt, eine unabhängige und offene PubMed-Alternative aufzubauen, zusammen und schildert ihre Sicht auf das Vorhaben von ZB MED.
Die FAIR Data Principles sind vielen geläufig. Aber auch Forschungssoftware sollte FAIR sein. Um dies zu erreichen, wurden die FAIR for Research Software Principles implementiert. Was sich dahinter verbirgt und wie der Stand der Umsetzung ist, lesen Sie hier.
During the planning of the festival, the organizers, were looking for new formats for the celebration of open science and came across Ignite Talks. What is an Ignite talk? And what were the Ignite Talks at the festival about.
One of the workshops at the Open Science Festival 2023 entitled “Python Introduction for Research Analysis” was hosted by Rabea Müller and Vanessa Scharf. With great enthusiasm, 11 participants took part in this live coding session to expand their knowledge of Python and equip themselves to conduct research analysis.
Data stewardship is about making research data FAIR, and is an important ingredient for open science. An interactive workshop at the Open Science Festival aimed to bring together various perspectives, from (young) researchers, data stewards, information professionals to those from an institutional point of view to learn about the needs, experiences in working together with a diverse group of stakeholders, as well as good practices.
Im Rahmen des Open Science-Festivals 2023 wurde vom Forschungsdatenmanagement-Team von ZB MED ein Workshop zu Datenmanagementplänen veranstaltet. Ziel des Workshops war es, die Teilnehmer:innen an dieses immer stärker in den Fokus des Forschungsdatenmanagements rückende Thema heranzuführen – ein Bericht von Roman Riedel.
In der Mikrobiologie besteht ein großes Ungleichgewicht bei den Informationen über verschiedene Arten von Bakterien. Für die große Mehrheit der Bakterien sind bestenfalls Sequenzinformationen aus dem Genom verfügbar. Das Gemeinschaftsprojekt DiASPora von ZB MED, DSMZ und TIB wendet KI-basierte Ansätze an, um die Lücke zu schließen. Ausgangspunkt für diesen Ansatz ist die Datenbank BacDive, die größte Quelle für standardisierte phänotypische Daten über Bakterien.
Eine Voraussetzung für die Nachnutzung von Forschungsdaten sind FAIRe Metadaten, also strukturierte Daten, die die Forschungsdaten beschreiben. Sie bieten idealerweise semantisch eindeutige Beschreibungen der Daten. Um die (Meta-)Daten über ihren ursprünglichen Zweck hinaus und in verschiedenen Umgebungen direkt wiederverwenden zu können, müssen diese interoperabel sein. Daher sollten auch die Terminologien, die für Beschreibungen verwendet werden, den FAIR-Grundsätzen folgen und eine formale und zugängliche Sprache zur Wissensdarstellung ermöglichen. Ein Beitrag von Prof. Dr. Juliane Fluck.
Im Jahr 2020 fiel der Startschuss für das Konsortium NFDI4Health – die Nationale Forschungsdateninfrastruktur für personenbezogene Gesundheitsdaten – und das DFG-geförderte Projekt NFDI4Health Taskforce COVID-19. Beide arbeiten eng zusammen. Zwei Jahre später sind wichtige Ziele erreicht und konkrete Maßnahmen umgesetzt: Ein Rückblick auf zwei Jahre NFDI4Health – Services und Anwendungen – wichtige Beiträge von ZB MED.
Ein neues Berufsbild zur Unterstützung beim Forschungsdatenmanagement nimmt Form an. Von Birte Lindstädt und Konrad Förstner: ZB MED ist in viele Forschungsprojekte involviert, in denen es darum geht, Forschende in den Lebenswissenschaften im Forschungsdatenmanagement zu unterstützen. Ein Schwerpunkt liegt in der Beteiligung an fachspezifischen Konsortien der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur. Neben der…